Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NAP1L3Q99457 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAP1L3Q99457 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms