Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCMH1Q96GD3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCMH1Q96GD3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms