Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms