Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms