Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCAMP4Q969E2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCAMP4Q969E2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms