Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM9SF4Q92544 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms