Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms