Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BEST4Q8NFU0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms