Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VPS8Q8N3P4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms