Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms