Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTF1AQ7RTS3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
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