Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MICAL3Q7RTP6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms