Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL2Q6F5E8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms