Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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SAPCD1Q5SSQ6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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SAPCD1Q5SSQ6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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