Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms