Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms