Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MICAQ29983 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MICAQ29983 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
MICAQ29983 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MICAQ29983 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms