Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLFQ16534 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLFQ16534 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLFQ16534 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLFQ16534 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLFQ16534 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLFQ16534 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLFQ16534 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HLFQ16534 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLFQ16534 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms