Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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DDB1Q16531 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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DDB1Q16531 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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DDB1Q16531 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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DDB1Q16531 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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DDB1Q16531 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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DDB1Q16531 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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DDB1Q16531 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDB1Q16531 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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