Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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