Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms