Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms