Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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SCARF1Q14162 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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