Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
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