Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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