Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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