Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTGDRQ13258 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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