Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD4Q12950 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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