Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms