Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms