Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms