Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms