Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR1P84550 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms