Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ACTBP60709 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ACTBP60709 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ACTBP60709 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACTBP60709 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTBP60709 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTBP60709 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTBP60709 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTBP60709 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTBP60709 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACTBP60709 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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