Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX16P57768 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX16P57768 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX16P57768 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX16P57768 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX16P57768 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX16P57768 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX16P57768 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX16P57768 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX16P57768 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms