Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRPF1P55201 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms