Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NESP48681 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NESP48681 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NESP48681 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NESP48681 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NESP48681 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NESP48681 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NESP48681 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NESP48681 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NESP48681 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NESP48681 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NESP48681 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NESP48681 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NESP48681 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NESP48681 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NESP48681 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NESP48681 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NESP48681 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NESP48681 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NESP48681 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms