Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms