Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRPPRCP42704 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRPPRCP42704 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms