Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN7P35236 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms