Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms