Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPREP23469 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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