Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms