Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF3P18847 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF3P18847 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms