Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAV1P15498 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
VAV1P15498 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VAV1P15498 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
VAV1P15498 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAV1P15498 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms