Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRF1P14222 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRF1P14222 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRF1P14222 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRF1P14222 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRF1P14222 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRF1P14222 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRF1P14222 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRF1P14222 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms