Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms