Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CFTRP13569 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CFTRP13569 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CFTRP13569 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CFTRP13569 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CFTRP13569 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFTRP13569 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFTRP13569 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFTRP13569 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFTRP13569 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFTRP13569 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFTRP13569 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFTRP13569 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFTRP13569 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFTRP13569 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFTRP13569 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFTRP13569 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFTRP13569 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFTRP13569 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CFTRP13569 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CFTRP13569 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFTRP13569 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFTRP13569 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFTRP13569 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFTRP13569 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFTRP13569 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFTRP13569 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CFTRP13569 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFTRP13569 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFTRP13569 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFTRP13569 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CFTRP13569 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFTRP13569 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFTRP13569 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFTRP13569 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFTRP13569 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CFTRP13569 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFTRP13569 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFTRP13569 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFTRP13569 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFTRP13569 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFTRP13569 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFTRP13569 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFTRP13569 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFTRP13569 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms