Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8BP10966 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8BP10966 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8BP10966 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8BP10966 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8BP10966 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8BP10966 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD8BP10966 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD8BP10966 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD8BP10966 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD8BP10966 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD8BP10966 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD8BP10966 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD8BP10966 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD8BP10966 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms