Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCL3P10147 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCL3P10147 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCL3P10147 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCL3P10147 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3P10147 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3P10147 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3P10147 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3P10147 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3P10147 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3P10147 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3P10147 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3P10147 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3P10147 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3P10147 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3P10147 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3P10147 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3P10147 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3P10147 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms